COVID-19 Mutanten

Rekombinante SARS-CoV-2-Spike-Protein-Varianten

Welche Mutationen im Coronavirus SARS-CoV-2 verursachen die höhere Übertragbarkeit besorgniserregender neuer Virusvarianten (variants of concern, VoC)? Unsere rekombinanten SARS-CoV-2 Spike-Proteine helfen bei der Untersuchung neuer Mutationen und deren Auswirkungen.

Bei allen RNA-Viren, so auch bei SARS-CoV-2, treten aufgrund der hohen Fehlerrate der RNA-Polymerasen häufig Mutationen auf, oftmals ohne phänotypische Auswirkungen. Von neuen Varianten des Virus (variant of interest VoI oder variant of concern VoC) spricht man, wenn diese Mutationen die Virulenz, Übertragbarkeit oder Mortalität des Virus verändern.

Sequenz und Struktur des COVID-19-Erregers SARS-CoV-2 sind gut untersucht und beschrieben. Von besonderem Interesse im Hinblick auf Diagnostik und Medikamentenentwicklung ist das Spike-Protein (S-Protein) aufgrund seiner Rolle bei der Interaktion mit menschlichen Wirtsrezeptoren. Seit Beginn der Zirkulation von SARS-CoV-2 im Menschen haben die Viren durch Mutationen eine zunehmende Anzahl von polymorphen Nukleotidpositionen erworben. Der Einfluss dieser Mutationen auf Eigenschaften wie Übertragbarkeit, Virulenz oder Immunogenität ist Gegenstand intensiver Untersuchungen. 

Virale Varianten mit der D614G-Spike-Mutation waren zu Beginn der Pandemie selten, sind jetzt aber weltweit verbreitet, was auf eine erhöhte Übertragbarkeit zurückzuführen ist (Korber et al.). Einige davon sind inzwischen in vielen Ländern verbreitet, so die Alpha-Variante B.1.1.7 (Rambaud et al.), die Beta-Variante B.1.351 (Tegally et al.), die Gamma-Variante B.1.1.28 P.1 (Singh et al.) und die Delta-Variante B.1.617.2 (Mlcochova et al.).

Die Omicron-Variante B.1.1.529, die erstmals im November 2021 in Südafrika auftrat und inzwischen das Pandemiegeschehen in Europa weitgehend bestimmt, hat sich phylogenetischen Studien zufolge unabhängig von der Delta-Variante entwickelt. Sie weist im Vergleich zum ursprünglichen SARS-CoV-2 zahlreiche Mutationen im Spike-Protein auf, darunter solche mit bekannten phänotypischen Auswirkungen (Zunahme der Übertragung, Immunevasion, Übertragbarkeit), aber auch Mutationen, deren Bedeutung noch unklar ist. (Saxena et al.)

 

Eine Untergruppe der in der RBD-Domäne des Spike-Proteins identifizierten Mutationen tritt in mehr als einem Stamm auf, obwohl diese Varianten sich vermutlich unabhängig voneinander entwickelt haben. Diese konvergenten Mutationen, insbesondere N501Y (enthalten in den Varianten B.1.1.7, B.1.351 und B.1.1.28 P.1) und E484K (enthalten in B.1.351, B.1.1.28 P.1 und der Sweden-1-Variante), sind von hohem Interesse, da sie die Ursache für die erhöhte Übertragbarkeit sein könnten (Zahradnik et al.). Darüber hinaus reduzieren die Polymorphismen K417N und E484K die Empfindlichkeit gegenüber neutralisierenden Antikörpern (Greaney et al.), was auf eine verminderte Wirksamkeit der Immunantwort nach Infektion bzw. Impfung hinweisen könnte.

Fig: 3D-Struktur des Spike-Trimers, eingebettet in eine Lipid-Doppelschicht. 
Mutanten sind grün dargestellt und entsprechend beschriftet. (Quelle: The Native Antigen)

 

Um Sie bei der Untersuchung und Verfolgung der neu auftretenden SARS-CoV-2-Varianten zu unterstützen, arbeiten unsere Lieferanten daran, Ihnen rekombinante Spike-Proteine der neu auftretenden Mutanten jeweils so schnell wie möglich zur Verfügung zu stellen.

 

Ausgewählte rekombinante SARS-CoV-2-Mutanten Spike-Proteine:

 

SARS-CoV-2 Variante	Mutationen	Art.-Nr.	Produktbeschreibung
Europäische Variante B1	D614G	SCM-C19S1-G231H	Signalchem SARS-CoV-2 Spike Protein S1 (D614G)
		SIN-40591-V08H3	Sino Biological SARS-CoV-2 S1 Spike Protein (D614G)-His, HPLC-verifiziert
Alpha Variante B.1.1.7	del69-70, del144, N501Y, A570D, D614G, P681H,T716I, S982A, D1118H	GTX136059-PRO	GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike (del69-70,del144,N501Y,A570D,D614G,...) (ECD) Protein, His tag (active), Unconjugated
		NAC-REC31924-100	The Native Antigen SARS-CoV-2 (B.1.1.7) Stabilized Spike Glycoprotein, His-Strep-Tag (HEK293)
		NAC-REC31946-100	The Native Antigen SARS-CoV-2 (N501Y Mutant) Spike Glycoprotein (S1) RBD, His-Tag (HEK293)
		SIN-40592-V08H82	Sino Biological SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike RBD(N501Y)-His Recombinant Protein
Beta Variante B.1.351 (501Y.V2)	L18F, D80A, D215G, del242-244, K417N, E484K, N501Y, D614G, A701V	GTX136022-PRO	GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike RBD (K417N, E484K, N501Y Mutant) protein, His tag (active), Unconjugated
		GTX136095-PRO	GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike S1 (L18F, D80A,..., R246I, K417N, E484K, N501Y, D614G), His tag (active), Unconjugated
		NAC-REC31963-100	The Native Antigen SARS-CoV-2 (B.1.351) Stabilized Spike Glycoprotein (Trimeric), His-Strep-Tag (HEK293)
		NAC-REC31926-100	The Native Antigen SARS-CoV-2 (501.V2) Stabilized Spike Glycoprotein (Full-Length), His-Strep-Tag (HEK293
		NAC-REC31945-100	The Native Antigen SARS-CoV-2 (501Y.V2: K417N, E484K, N501Y) Spike Glycoprotein (S1) RBD, His-Tag (HEK293)
		BIV-P1645-50	BioVision Human CellExp(TM) SARS-CoV-2 Spike RBD (K417N, E484K, N501Y)
		ELA-PKSV030319	Elabscience Recombinant SARS-CoV-2 Spike RBD (K417N,E484K,N501Y) (His Tag)
		DBP-DPREC-021	Daresbury Proteins SARS-CoV-2 trimeric soluble full-length Spike protein, Beta variant, S protein, HEK293 cells
		ABX160085	Abexxa SARS-CoV-2 S1 Protein RBD (Beta B.1.351 Variant), Unconjugated, Insect
Gamma Variante B.1.1.28 P1	L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S, K417T, E484K, N501Y, D614G, H655Y, T1027I, V1176F	GTX136091-PRO	GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike (ECD) Protein, P.1 / Gamma variant, His tag (active), Unconjugated
		GTX136043-PRO	GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike RBD Protein, P.1 / Gamma variant, His tag (active), Unconjugated
		GTX136094-PRO	GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike S1 Protein, P.1 / Gamma variant, His tag (active), Unconjugated
		NAC-REC31944-100	The Native Antigen SARS-CoV-2 (B.1.1.28)Stabilized Spike Glycoprotein (Full-Length), His-Strep-Tag (HEK293)
		NAC-REC31961-100	The Native Antigen SARS-CoV-2 (B.1.1.28: K417T, E484K, N501Y) Spike Glycoprotein (S1) RBD, His-Tag (HEK293)
Delta Variante B.1.617.2	L452R, T478K	GTX136332-PRO	GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike RBD (L452R, T478K Mutant) protein, His tag, Unconjugated
		NAC-REC31974-100	The Native Antigen SARS-CoV-2 (B.1.617.2, L452R, T478K) Spike Glycoprotein (S1) RBD, His-Tag (HEK293)
		SIN-40589-V08H10	Sino Biological SARS-CoV-2 B.1.617.2 Spike S1+S2 trimer Protein (ECD, His tag)
		DBP-DPREC-024	Daresbury Proteins SARS-CoV-2 trimeric soluble full-length Spike protein, Delta variant, S protein, HEK293 cells
		PRS-21-831	ProSci SARS-CoV-2 (COVID-19) Delta Variant (B.1.617.2) Spike RBD (L452R, T478K) Recombinant Protein
		ABX620012	Abbexxa SARS-CoV-2 Spike Protein RBD (Delta B.1.617.2 Variant), Unconjugated, Mammalian cells
Kappa Variante B.1.617.1	E484Q, L452R	NAC-REC31971-100	The Native Antigen SARS-CoV-2 (B.1.617.1: E484Q, L452R) Spike Glycoprotein (S1) RBD, His-Tag (HEK293)
		GTX136299-PRO	GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike RBD (L452R, E484Q Mutant) protein, His tag (active), Unconjugated
		SIN-40589-V08H11	Sino Biological SARS-CoV-2 B.1.617.1 Spike S1+S2 trimer Protein (ECD, His tag)
Omikron Variante B.1.1.529	A67V, H69del, V70del, T95I, G142D, V143del, Y144del, Y145del, N211del, L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954	GTX136716-PRO	SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike RBD Protein, B.1.1.529 / Omicron variant, His tag, Unconjugated
		SIN-40592-V08H121	Sino Biological SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) Spike RBD Protein (His Tag)
		SIN-40591-V08H41	Sino Biological SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) Spike S1 Protein (His Tag)
		SIN-40589-V08H26	Sino Biological SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) S1+S2 trimer Protein ( ECD, His Tag)
		SCM-C19S1-G231OH	Signalchem 2019-nCoV Spike protein S1 (Omicron)
		SCM-C19SD-G231OH	SignalChem 2019-nCoV Spike protein RBD (Omicron)
		MCE-HY-P74443	MedchemExpress SARS-CoV-2 Nucleocapsid Protein (Omicron, B.1.1.529, His)
		MCE-HY-P74444	MedchemExpress SARS-CoV-2 S Protein (Omicron, B.1.1.529, His)
		MCE-HY-P74445	MedchemExpress SARS-CoV-2 S1 Protein (Omicron, B.1.1.529, His)
		MCE-HY-P74447	MedchemExpress SARS-CoV-2 S Protein RBD (Omicron, B.1.1.529, His)
B1.1.298	Y453F	SIN-40592-V08H80	Sino Biological SARS-CoV-2 Spike RBD(Y453F)-His rekombinantes Protein
B.1.141 / B1.258	N439K	SIN-40592-V08H14	Sino Biological SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike RBD(N439K)-His rekombinantes Protein

 

Von System Biosciences sind Lentivector Packaging Mixes erhältlich, die mit dem SARS-CoV-2 S1-Spike-Protein in mehreren Varianten pseudotypisiert sind, darunter die Beta-Variante B.1.351 (K417N, E484K, N501Y und D614G).

 

Weitere SARS-CoV-2 mutierte Spike-Proteine sind bei mehreren unserer Lieferanten in der Entwicklung. 

Suchen Sie nach einer bestimmten Mutation, die in unserem Shop noch nicht verfügbar ist? Kontaktieren Sie uns gerne, und wir bemühen uns darum, das passende Protein für Sie aufzutreiben.