COVID-19 Mutanten

Rekombinante SARS-CoV-2-Spike-Protein-Varianten

Welche Mutationen im Coronavirus SARS-CoV-2 verursachen die höhere Übertragbarkeit besorgniserregender neuer Virusvarianten (variants of concern, VoC)? Unsere rekombinanten SARS-CoV-2 Spike-Proteine helfen bei der Untersuchung neuer Mutationen und deren Auswirkungen.

Bei allen RNA-Viren, so auch bei SARS-CoV-2, treten aufgrund der hohen Fehlerrate der RNA-Polymerasen häufig Mutationen auf, oftmals ohne phänotypische Auswirkungen. Von neuen Varianten des Virus (variant of interest VoI oder variant of concern VoC) spricht man, wenn diese Mutationen die Virulenz, Übertragbarkeit oder Mortalität des Virus verändern.

Sequenz und Struktur des COVID-19-Erregers SARS-CoV-2 sind gut untersucht und beschrieben. Von besonderem Interesse im Hinblick auf Diagnostik und Medikamentenentwicklung ist das Spike-Protein (S-Protein) aufgrund seiner Rolle bei der Interaktion mit menschlichen Wirtsrezeptoren. Seit Beginn der Zirkulation von SARS-CoV-2 im Menschen haben die Viren durch Mutationen eine zunehmende Anzahl von polymorphen Nukleotidpositionen erworben. Der Einfluss dieser Mutationen auf Eigenschaften wie Übertragbarkeit, Virulenz oder Immunogenität ist Gegenstand intensiver Untersuchungen. 

Virale Varianten mit der D614G-Spike-Mutation waren zu Beginn der Pandemie selten, sind jetzt aber weltweit verbreitet, was auf eine erhöhte Übertragbarkeit zurückzuführen ist (Korber et al.). Einige davon sind inzwischen in vielen Ländern verbreitet, so die Alpha-Variante B.1.1.7 (Rambaud et al.), die Beta-Variante B.1.351 (Tegally et al.), die Gamma-Variante B.1.1.28 P.1 (Singh et al.) und die Delta-Variante B.1.617.2 (Mlcochova et al.).

Die Omicron-Variante B.1.1.529, die erstmals im November 2021 in Südafrika auftrat und inzwischen das Pandemiegeschehen in Europa weitgehend bestimmt, hat sich phylogenetischen Studien zufolge unabhängig von der Delta-Variante entwickelt. Sie weist im Vergleich zum ursprünglichen SARS-CoV-2 zahlreiche Mutationen im Spike-Protein auf, darunter solche mit bekannten phänotypischen Auswirkungen (Zunahme der Übertragung, Immunevasion, Übertragbarkeit), aber auch Mutationen, deren Bedeutung noch unklar ist. (Saxena et al.)

 

Eine Untergruppe der in der RBD-Domäne des Spike-Proteins identifizierten Mutationen tritt in mehr als einem Stamm auf, obwohl diese Varianten sich vermutlich unabhängig voneinander entwickelt haben. Diese konvergenten Mutationen, insbesondere N501Y (enthalten in den Varianten B.1.1.7, B.1.351 und B.1.1.28 P.1) und E484K (enthalten in B.1.351, B.1.1.28 P.1 und der Sweden-1-Variante), sind von hohem Interesse, da sie die Ursache für die erhöhte Übertragbarkeit sein könnten (Zahradnik et al.). Darüber hinaus reduzieren die Polymorphismen K417N und E484K die Empfindlichkeit gegenüber neutralisierenden Antikörpern (Greaney et al.), was auf eine verminderte Wirksamkeit der Immunantwort nach Infektion bzw. Impfung hinweisen könnte.

Fig: 3D-Struktur des Spike-Trimers, eingebettet in eine Lipid-Doppelschicht. 
Mutanten sind grün dargestellt und entsprechend beschriftet. (Quelle: The Native Antigen)

 

Um Sie bei der Untersuchung und Verfolgung der neu auftretenden SARS-CoV-2-Varianten zu unterstützen, arbeiten unsere Lieferanten daran, Ihnen rekombinante Spike-Proteine der neu auftretenden Mutanten jeweils so schnell wie möglich zur Verfügung zu stellen.

 

Ausgewählte rekombinante SARS-CoV-2-Mutanten Spike-Proteine:

 

SARS-CoV-2 Variante Mutationen Art.-Nr. Produktbeschreibung

Europäische Variante B1

D614G SCM-C19S1-G231H Signalchem SARS-CoV-2 Spike Protein S1 (D614G)
SIN-40591-V08H3

Sino Biological SARS-CoV-2 S1 Spike Protein (D614G)-His, HPLC-verifiziert

Alpha Variante B.1.1.7

del69-70, del144, N501Y, A570D,

D614G, P681H,T716I, S982A, D1118H

GTX136059-PRO

GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike (del69-70,del144,N501Y,A570D,D614G,...) (ECD) Protein, His tag (active), Unconjugated

NAC-REC31924-100 The Native Antigen SARS-CoV-2 (B.1.1.7) Stabilized Spike Glycoprotein, His-Strep-Tag (HEK293)
NAC-REC31946-100 The Native Antigen SARS-CoV-2 (N501Y Mutant) Spike Glycoprotein (S1) RBD, His-Tag (HEK293)
SIN-40592-V08H82 Sino Biological SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike RBD(N501Y)-His Recombinant Protein

Beta Variante B.1.351 (501Y.V2)

L18F, D80A, D215G, del242-244, K417N, E484K, N501Y, D614G, A701V GTX136022-PRO GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike RBD (K417N, E484K, N501Y Mutant) protein, His tag (active), Unconjugated
GTX136095-PRO GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike S1 (L18F, D80A,..., R246I, K417N, E484K, N501Y, D614G), His tag (active), Unconjugated
NAC-REC31963-100 The Native Antigen SARS-CoV-2 (B.1.351) Stabilized Spike Glycoprotein (Trimeric), His-Strep-Tag (HEK293)
NAC-REC31926-100 The Native Antigen SARS-CoV-2 (501.V2) Stabilized Spike Glycoprotein (Full-Length), His-Strep-Tag (HEK293
NAC-REC31945-100 The Native Antigen SARS-CoV-2 (501Y.V2: K417N, E484K, N501Y) Spike Glycoprotein (S1) RBD, His-Tag (HEK293)
BIV-P1645-50 BioVision Human CellExp(TM) SARS-CoV-2 Spike RBD (K417N, E484K, N501Y)
ELA-PKSV030319 Elabscience Recombinant SARS-CoV-2 Spike RBD (K417N,E484K,N501Y) (His Tag)
DBP-DPREC-021 Daresbury Proteins SARS-CoV-2 trimeric soluble full-length Spike protein, Beta variant, S protein, HEK293 cells
ABX160085 Abexxa SARS-CoV-2 S1 Protein RBD (Beta B.1.351 Variant), Unconjugated, Insect

Gamma Variante B.1.1.28 P1

L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S, K417T, E484K, N501Y, D614G, H655Y, T1027I, V1176F

GTX136091-PRO GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike (ECD) Protein, P.1 / Gamma variant, His tag (active), Unconjugated
GTX136043-PRO GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike RBD Protein, P.1 / Gamma variant, His tag (active), Unconjugated
GTX136094-PRO GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike S1 Protein, P.1 / Gamma variant, His tag (active), Unconjugated
NAC-REC31944-100 The Native Antigen SARS-CoV-2 (B.1.1.28)Stabilized Spike Glycoprotein (Full-Length), His-Strep-Tag (HEK293)
NAC-REC31961-100 The Native Antigen SARS-CoV-2 (B.1.1.28: K417T, E484K, N501Y) Spike Glycoprotein (S1) RBD, His-Tag (HEK293)

Delta Variante B.1.617.2

L452R, T478K GTX136332-PRO

GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike RBD (L452R, T478K Mutant) protein, His tag, Unconjugated

NAC-REC31974-100 The Native Antigen SARS-CoV-2 (B.1.617.2, L452R, T478K) Spike Glycoprotein (S1) RBD, His-Tag (HEK293)
SIN-40589-V08H10 Sino Biological SARS-CoV-2 B.1.617.2 Spike S1+S2 trimer Protein (ECD, His tag)
DBP-DPREC-024 Daresbury Proteins SARS-CoV-2 trimeric soluble full-length Spike protein, Delta variant, S protein, HEK293 cells
PRS-21-831 ProSci SARS-CoV-2 (COVID-19) Delta Variant (B.1.617.2) Spike RBD (L452R, T478K) Recombinant Protein
ABX620012 Abbexxa SARS-CoV-2 Spike Protein RBD (Delta B.1.617.2 Variant), Unconjugated, Mammalian cells

Kappa Variante B.1.617.1

E484Q, L452R NAC-REC31971-100

The Native Antigen SARS-CoV-2 (B.1.617.1: E484Q, L452R) Spike Glycoprotein (S1) RBD, His-Tag (HEK293)

GTX136299-PRO GeneTex SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike RBD (L452R, E484Q Mutant) protein, His tag (active), Unconjugated
SIN-40589-V08H11 Sino Biological SARS-CoV-2 B.1.617.1 Spike S1+S2 trimer Protein (ECD, His tag)

Omikron Variante B.1.1.529

A67V, H69del, V70del, T95I, G142D, V143del, Y144del, Y145del, N211del, L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954 GTX136716-PRO SARS-CoV-2 (COVID-19) Spike RBD Protein, B.1.1.529 / Omicron variant, His tag, Unconjugated
SIN-40592-V08H121 Sino Biological SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) Spike RBD Protein (His Tag)
SIN-40591-V08H41 Sino Biological SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) Spike S1 Protein (His Tag)
SIN-40589-V08H26 Sino Biological SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) S1+S2 trimer Protein ( ECD, His Tag)
SCM-C19S1-G231OH Signalchem 2019-nCoV Spike protein S1 (Omicron)
SCM-C19SD-G231OH SignalChem 2019-nCoV Spike protein RBD (Omicron)
MCE-HY-P74443 MedchemExpress SARS-CoV-2 Nucleocapsid Protein (Omicron, B.1.1.529, His)
MCE-HY-P74444 MedchemExpress SARS-CoV-2 S Protein (Omicron, B.1.1.529, His)
MCE-HY-P74445 MedchemExpress SARS-CoV-2 S1 Protein (Omicron, B.1.1.529, His)
MCE-HY-P74447 MedchemExpress SARS-CoV-2 S Protein RBD (Omicron, B.1.1.529, His)

B1.1.298

Y453F SIN-40592-V08H80 Sino Biological SARS-CoV-2 Spike RBD(Y453F)-His rekombinantes Protein

B.1.141 / B1.258

N439K SIN-40592-V08H14 Sino Biological SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike RBD(N439K)-His rekombinantes Protein

 

Von System Biosciences sind Lentivector Packaging Mixes erhältlich, die mit dem SARS-CoV-2 S1-Spike-Protein in mehreren Varianten pseudotypisiert sind, darunter die Beta-Variante B.1.351 (K417N, E484K, N501Y und D614G).

 

Weitere SARS-CoV-2 mutierte Spike-Proteine sind bei mehreren unserer Lieferanten in der Entwicklung. 

Suchen Sie nach einer bestimmten Mutation, die in unserem Shop noch nicht verfügbar ist? Kontaktieren Sie uns gerne, und wir bemühen uns darum, das passende Protein für Sie aufzutreiben.

 

 

26.01.2022

Andere News

Cathepsin K

Magic Red® Cathepsin...

In vitro Überwachung intrazellulärer Cathepsin-Aktivität

Cytoskeleton MemGlow™ fluorescent probes

Cytoskeleton MemGlow...

Fluoreszierende Plasmamembran-Färbung

Lab Rodent

BIOZOL Hamsterwochen...

Preise aus 2022 im Jahr 2023!

Cancer Cells

GeneTex Webinar

Extrazelluläre Vesikel als Biomarker in der Krebstherapie

Collagen Detection

Kollagen-Detektion

ELISA-Kits für die Quantifizierung von Typ I und Typ II Kollagen